彭迪

彭博士于2017年7月至2022年5月在华中科技大学从事博士后研究；2022年6月起在华中科技大学任副教授。彭博士现任中国计算机学会生物信息学专委会委员、中国生物物理学会人工智能生物学分会秘书。彭博士聚焦代谢稳态调控的计算解析这一关键科学问题，结合蛋白质组开展系统性研究，其特色在于：（1）发展生物学知识驱动的计算模型与思维链推理技术，构建动态分子网络模拟方法，实现非线性调控关系的精准预测（Nature Biomedical Engineering, 2026，共同通讯；Briefings in Bioinformatics, 2025，共同通讯；Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2025，共同通讯）；（2）融合表型定量分析与机器学习，发掘参与代谢重塑的关键功能元件，建立核心节点的精准识别策略（Nature Communications, 2024，共同第一；Nucleic Acids Research, 2024，共同通讯）；（3）采用网络拓扑分析与层次学习策略，从组学数据中解析维持物质代谢稳态的核心分子信息流，揭示代谢调控的时空依赖性机制（Science Bulletin, 2024，第一作者；Autophagy, 2021a，共同通讯；Autophagy, 2021b，第一作者）。相关研究为代谢相关疾病防控提供理论支撑与方法学基础。

代表作：
1. Tang D#, Zhang C#, Zhang W#, Lu F, Xiao L, Huang X, Shao J, Liu D, Fu S, Zhao M, Zhang L, Jia D, Shen HM, Sun C, Chen G, Liu B, Peng D, Xue Y. A deep learning and large language hybrid workflow for omics interpretation. Nature Biomedical Engineering, 2026, doi: 10.1038/s41551-025-01576-5.
2. Peng D#, Zheng L#, Liu D#, Han C#, Wang X, Yang Y, Song L, Zhao M, Wei Y, Li J, Ye X, Wei Y, Feng Z, Huang X, Chen M, Gou Y, Xue Y, Zhang L. Large-language models facilitate discovery of the molecular signatures regulating sleep and activity. Nature Communications, 2024, 15(1): 3685.
3. Gou Y#, Liu D#, Chen M, Wei Y, Huang X, Han C, Feng Z, Zhang C, Lu T, Peng D, Xue Y*. GPS-SUMO 2.0: an updated online service for the prediction of SUMOylation sites and SUMO-interacting motifs. Nucleic Acids Research, 2024, 52(W1): W238-W247.
4. Peng D, Ruan C, Fu S, He C, Song J, Li H, Tu Y, Tang D, Yao L, Lin S, Shi Y, Zhang W, Zhou H, Zhu L, Ma C, Chang C, Ma J, Xie Z, Wang C, Xue Y. Atg9-centered multi-omics integration reveals new autophagy regulators in Saccharomyces cerevisiae. Autophagy, 2021, 17(12): 4453-4476.
5. Ruan C#, Wang C#, Gong X#, Zhang Y, Deng W, Zhou J, Huang D, Wang Z, Zhang Q, Guo A, Lu J, Gao J, Peng D, Xue Y*. An integrative multi-omics approach uncovers the regulatory role of CDK7 and CDK4 in autophagy activation induced by silica nanoparticles. Autophagy, 2021, 17(6): 1426-1447.