钟传奇

研究领域：
1.蛋白组学方法的开发：蛋白组学是研究生物样品中所有蛋白的功能状态的学科，它分为样品前处理，质谱数据采集和质谱数据生物信息学分析三个部分。其中，我们开发了数据不依赖质谱（Data-independent acquisition mass spectrometry, DIA-MS）数据的算法（Nature Methods, 2015）,此算法可以不依赖于数据依赖质谱（Data-dependent acquisition mass spectrometry, DDA-MS）而可直接分析DIA-MS数据。此外我们开发了基于SDS的蛋白组学样品制备方法SCASP (MCP, 2021)以及无需脱盐方法的翻译后修饰富集方法SCASP-PTM (Cell Reports, 2025).
2.先天免疫和肿瘤免疫信号通路分子机制研究：我们整合自主研发的蛋白组学技术与高通量CRISPR/Cas9筛选工具，系统解析信号通路中关键的调控机制。利用SCASP-PTM方法分析了RNA类似物poly(I:C)刺激HeLa-S3细胞的蛋白、泛素化修饰、磷酸化修饰和糖基化修饰的变化，发现poly(I:C)诱导GSK3B介导的p62蛋白28位磷酸化，进而诱发TNFAIP1介导的420位赖氨酸泛素化，最终导致p62降解并减弱细胞自噬 (Cell Reports, 2025)。此外，利用SCASP-PTM方法分析了临床肺癌和癌旁组织的总蛋白、泛素化修饰、乙酰化修饰、磷酸化修饰和糖基化修饰的变化，揭示了ALDOA的K330的乙酰化修饰和泛素化修饰促进了肿瘤的发展 (Cell Reports, 2025)。

代表论文：
1. Lin ZP, Gan G, Xu X, Wen C, Ding X, Chen XY, Zhang K, Guo WY, Lin M, Wang YY, Chen X, Xie C, Wang J*, Li M*, Zhong CQ*. Comprehensive PTM profiling with SCASP-PTM uncovers mechnisms of p62 degradation and ALDOA-mediated tumor progression. Cell Rep. 2025 Apr 3;44(4):115500. Doi: 10.1016/j.celrep.2025.115500. (IF=7.5)
2. Wen C, Wu X*, Lin G, Yan W, Gan G, Xu X, Chen XY, Chen X, Liu X, Fu G*, Zhong CQ*. Evaluation of DDA Library-Free Strategies for Phosphoproteomics and Ubiquitinomics Data-Independent Acquisition Data. J Proteome Res. 22, 2232-2245 (2023). (IF=5.3)